L'activité d’expérimentation a démarré au CTCS en 2000. En 2004, le CTCS Guadeloupe a obtenu son premier agrément BPE (Bonne Pratique d'Expérimentation) pour la réalisation d’essais B.P.E officiellement reconnus. Depuis plus d'une décennie, le CTCS est agréé pour la réalisation d'essais sur toutes les cultures tropicales, les produits récoltés, les cultures légumières et les plantes condimentaires et à parfums. En 2024, le CTCS a obtenu un agrément pour la réalisation d'essais en Martinique qui doit permettre dans un premier temps de répondre aux besoins de la filière banane.